甲基化芯片(MeDIP chip)数据报告包含哪些内容?

1 芯片原始图;

2 DNA QC;

3 芯片数据展示 (MA plot,box plot和相关系数分析图);

4 原始信号数据(raw data);

5 GFF files (scaled log2 ratio data, p value data, peaks data, annotation);

6 芯片分析结果(各个样品启动子区域甲基化的基因列表、各个样品CpG island区域甲基化情况列表、各个样品启动子区域差异甲基化的基因);

7 差异甲基化的基因及区域;

8 GO、Pathway 分析;

9 可视化文件,可用signalmap软件导出文章发表级别的甲基化分布图。



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