甲基化测序(MeDIP seq )数据是否可以和全基因表达谱芯片或lncRNA芯片联合应用?

       两个平台可以同时做,这样不仅可以缩小验证指标挑选范围而且可以从宏观角度来说明DNA甲基化对基因的转录调控。


     DNA甲基化和表达谱的联合分析:


     a)理论上甲基化水平升高会抑制基因的表达,但甲基化不是调控基因表达的唯一因素。所以联合分析的意义就在于:


     1 统计有多少甲基化变化的基因同时发生了表达的变化,也就是说在特定的条件下甲基化是不是调控基因表达的主要因素。


     2 缩小研究范围。甲基化测序或芯片筛选得到的差异基因往往数目众多给候选基因的筛选带来了困惑,结合表达谱能缩小范围找到有调控基因表达作用的甲基化变化,这个也是甲基化研究的意义所在。


     b) 联合分析的形式:1 韦恩图;2 热图。


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